Пензенский завод медицинских препаратов основан в 1959 году.

Основным направлением деятельности завода было избрано производство субстанций методом микробиологического синтеза, а первой продукцией - антибиотик биомицин и витамин В12. В списке субстанций антибиотиков далее появились олеандомицин, тетрациклин, нистатин, гелиомицин (удостоен золотой медали ВДНХ в 1970 г), фузидин, леворин (золотая медаль выставки в г. Пловдиве в 1977 г), бензилпенициллина калиевая соль, микогептин, сердечно-сосудистое средство - рибоксин. Наряду с субстанциями в номенклатуре завода еще в 1961 г появились и готовые лекарственные средства - таблетки, в 1971 г открыты комплексы по выпуску инфузионных растворов и фасовке инъекционных порошков. В 1986 году организовано производство препаратов из эндокринного сырья - инсулина, в 1989 г - гепарина. В связи с разнопрофильным характером производства завод в 1987 г преобразован в комбинат медицинских препаратов, а ноябре 1992 г - акционерное общество открытого типа "Биосинтез".

После 1992 г. ОАО «Биосинтез» испытало все многочисленные трудности, обусловленные распадом СССР: прекращение системы государственных закупок, стремительное увеличение цен на энергоносители, остановка предприятий – традиционных поставщиков сырья и материалов, нарушение корпоративных связей с бывшими республиками СССР.

Несмотря на сложнейшую финансово-экономическую ситуацию, политика руководства в этот период была направлена на резкое расширение производства готовых лекарственных препаратов в различных лекарственных формах при максимально возможном сохранении действующих производств субстанций антибиотиков.

В 1996 году открывается производство мазей в тубах, в 1997 году организован комплекс по выпуску инъекционных растворов в ампулах, в 1998 году выпущены первые промышленные серии суппозиториев.